刘肇基部一万五六千人、淮安卫约五千人驻守宿迁城，总指挥官为刘肇基；

淮扬镇团练扬州府团练一万七千多人、扬州卫一万五千多人、史德威督标营六千余人、何刚忠贯营五千余人、程秀夫忠杰营四千余人、李栖凤部近六千人、卢九德部约两千人驻守扬州城，总指挥官为史可法本人，副总指挥官为夏华；

淮扬军水师三万五千多人兵分两路，一路在长江上机动作战，一路在淮扬河湖上机动作战同时负责坚守邵伯镇；

张天禄、张天福部五千余人驻守瓜洲；

胡尚友部约三千人、韩尚良部两千多人、张应祥部近四千人驻守高邮城。

以上诸要地里，扬州城的军力最为雄厚，兵力五万五千多，并且还有数千名城内不少大户组建的团练家丁协助官军作战，这是必然的，整个淮扬，扬州城最重要，是核心，只要扬州城不丢，就算其它城池都丢了，清军也不算拿下淮扬，难以进攻南京。